生物安全柜工作臺通常是將預過濾器、過濾器、通風機、配電裝置等組裝在由金屬板材制成的箱體內， 成立獨立操作單元。通風機運轉后，形成一個向內的保護人的氣流，同時操作區頂部經空氣過濾的潔凈空氣， 呈垂直層流式流經操作區，對產品提供可靠保護。排風也經空氣過濾器， 以保護環境不受污染。因此正確使用生物安全柜，可以有效地減少由于氣溶膠暴露所造成實驗室感染以及培養物交叉污染等，規避感染風險。
生物安全柜的排風系統中裝有空氣過濾器，它能有效地截留所有已知傳染因子， 對于直徑0.3 μm 的顆粒它可以截留99.97%，對大于或小于直徑0.3 μm 的顆粒它可以截留99.99%，并確保從安全柜中排出的是不含微生物的空氣。因此正確使用生物安全柜可以有效地減少由于氣溶膠暴露或濺出物所造成的實驗室污染以及培養物等交叉污染，減少對環境和人身安全所造成的危害，有效地保護實驗室人員的健康與安全，減少職業暴露的發生。
加強生物安全柜正確使用，規避感染風險是至關重要的。正確的安裝和管理生物安全柜是保證工作臺操作區潔凈度的關鍵環節，嚴格規章制度，對使用的工具、材料和參觀人員進行嚴格的控制。為嚴防外界各種高速擾動氣流、面罩和防毒面具等，總之應按照不同級別的防護要求選擇適當的個人防護裝備 及類型。操作過中， 臺面不能存放過多物品，嚴禁堵塞前、后回風格柵， 如屬必需品，存放位置距回風口尺寸不得少于100 mm。操作時，操作者的雙臂以直線方向緩慢伸入生物安全柜，并至少靜止1min，使柜內氣流相對穩定后再進行操作。
綜上所述，只有了解生物安全柜的性能、結構、防護級別及一些注意事項，正確使用生物安全柜，才能針對自己實驗室選擇適合本實驗室使用生物安全柜，保護實驗環境不受污染，有效地減少由于氣溶膠暴露或有害氣體擴散所造成實驗室感染事件的發生，規避感染風險。